Uçak, Kagoshima Havalimanı’nın 34 numaralı pistinden kalkışını gerçekleştirirken sağ motorda (CF6) birkaç kuş türü tespit edildi. Durumu fark eden kokpit ekibi, 6.000 ft irtifada tırmanışı durdurarak beklemeye geçti ve gerekli prosedürleri uyguladı. Ardından uçak, kalkıştan yaklaşık 50 dakika sonra aynı piste güvenli bir iniş gerçekleştirdi. Yapılan ilk incelemede sağ motorun birkaç fan kanadında hasar tespit edildi.
Olayın ardından JL-646 seferi iptal edildi ve tüm yolcular alternatif uçuşlara yönlendirildi. JA612J kuyruk numaralı uçak, geri dönüş yapmasının üzerinden yaklaşık 29 saat geçmesine rağmen hâlâ Kagoshima’da yerde bekletiliyor. Teknik ekiplerin ayrıntılı inceleme ve bakım çalışmalarının sürdüğü bildirildi.
